『明初，窑移处州，青器土垩火候，渐不及前』。随着龙泉窑的衰落，琮式瓶的烧造转至其他窑口。明代传世的琮式瓶主要是石湾窑烧造的，釉色偏白，瓶上装饰八卦纹代替仿琮纹样，有的器物另加金属盖子、金属内胆，可能是作为盛装器物。
图1南宋龙泉窑青瓷琮式瓶高19.5cm台北“故宫博物院”藏
明代常用此类瓶作为花瓶的『蓍草瓶』，从器型上与琮式瓶基本一致，大者用于厅堂，小者用于书斋，为一枝瓶。项元汴《历代名瓷图谱》有『宋紫定小蓍草瓶』一件，外形与琮式瓶无异，并附文『小蓍草瓶，鉴家以为花器中款制上品，此瓶大小适中，以供砚头插花最妙』。『蓍草』作占卜之用，是长寿的象征，用来插蓍草的琮式瓶，应具有一定的象征吉祥寓意。
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《遵生八笺》中『古宋龙泉窑器……蓍草方瓶』，『小方蓍草瓶……官哥之上乘品也……大蓍草瓶……二窑之中乘品也』。袁宏道《瓶史》中『养花瓶亦须精良……大抵斋瓶宜矮而小……蓍草、蒲槌，皆须形制短小者，方入清供。』文震亨《长物志》中有记载：『瓷器用官、哥窑古胆瓶，一枝瓶，小蓍草瓶……龙泉、均州瓶，有极大高者，以插古梅，最相衬……』文献资料都提到，短小者插花最相衬。
图2《立花图卷》日本天文二十三年（）
现存的琮式瓶矮者十厘米左右，高者三十厘米左右，没有特别大的器型。日本天文二十三年(一五五四)《立花图卷》中左有一插花草的瓶子，从外形及其装饰的纹样看应是琮式瓶。同时期，浙江的墓室出土一件龙泉窑青釉带座琮式瓶，该墓为明正德三年的墓室。这件琮式瓶分为上下两段，上段是仿玉琮，下段是方型须弥座，座面上装饰如意云纹，近底边镂刻椭圆形方孔。这应该是首例给琮式瓶加座，可能仿照了当时玉琮陈设于木座之上，也可能受到佛教文化的影响。
图3明正德青釉带座琮式瓶高14.5cm口径2.2cm底径5cm龙泉青瓷博物馆藏
有的琮式瓶在瓶身刻字，如故宫博物院所藏的明宜兴窑月白釉琮式瓶，此瓶原藏于颐和园，方腹四面相对的两面分饰凸刻曲线纹和道家字铭『□从部令公位之□二十六寿』『□如广成子居空同千二百□』。明代有仿古玉琮传世，玉琮中间的孔很大，下端四边有小圆孔，器中有铜胆，可用来插花，并装饰了珐琅盖子，配置了紫檀木座。明末清初之际的一件琮型玉熏器，原器可能为新石器时代晚期不分节的素面玉琮，明清时期被改成目前的多节琮，器物四面还有乾隆皇帝的诗刻。这两件明清时期改装的玉琮充分体现了那个时代好古、崇古之风。
图4明仿古玉琮全高18.9口径9.6cm台北故宫博物院藏
明代的琮式瓶整体在前代的基础上有所变化，有意识的改造琮式瓶，用八卦纹代替仿玉琮的纹样，并且为琮瓶加盖使其方便盛装，或是加金属管便于插花，作为案头清玩之物。
